Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE7Q9UBL6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPNE7Q9UBL6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms