Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVK13-1Q9NX77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK13-1Q9NX77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms