Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRCC1Q9NPI7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRCC1Q9NPI7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.4 ms