Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1B3Q9NPD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms