Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1QTNF1Q9BXJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms