Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BBXQ8WY36 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBXQ8WY36 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBXQ8WY36 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms