Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS4Q8WXH5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOCS4Q8WXH5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms