Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACAD11Q709F0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAD11Q709F0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms