Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC181Q5TID7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms