Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC93Q567U6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC93Q567U6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms