Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A3Q16572 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A3Q16572 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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