Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CHKB-209ENST00000481673 1856 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-CPT1B-203ENST00000492556 4906 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 CHKB-202ENST00000463053 886 ntTSL 318.56■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 28.8
PCBP1Q15365 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 TMED5-203ENST00000370290 3847 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 TMED5-204ENST00000479918 1296 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.789e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.639e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.639e-8■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 NRSN2-207ENST00000608875 941 ntTSL 314.26□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 28.7
PCBP1Q15365 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 319.56■□□□□ 0.723e-9■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 213.65□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 212.92□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 EHMT2-206ENST00000461880 1825 ntTSL 515.25■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 EHMT2-210ENST00000478491 1517 ntTSL 513.17□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 EHMT2-212ENST00000494816 3036 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 520.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)17.56■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-238ENST00000493299 559 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-217ENST00000428387 524 ntTSL 412.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-11■■■■■ 28.6
PCBP1Q15365 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.444e-8■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 531.49■■■□□ 2.631e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.42■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 320.71■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 220.17■□□□□ 0.829e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.54e-8■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.379e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.249e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 316.52■□□□□ 0.249e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.129e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.39e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.549e-32■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-6■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 219.3■□□□□ 0.681e-29■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 224.29■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 523.62■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 523.39■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 523.11■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-212ENST00000579842 715 ntTSL 322.49■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 321.76■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-208ENST00000579004 341 ntTSL 313.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 SAMD4B-204ENST00000596271 578 nt13.25□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-216ENST00000582074 631 ntTSL 312.51□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-202ENST00000577286 553 ntTSL 212.4□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 DCXR-203ENST00000577532 573 ntTSL 38.97□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 28.5
PCBP1Q15365 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.72e-12■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.562e-12■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)19.83■□□□□ 0.772e-12■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 519.04■□□□□ 0.642e-12■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 216.45■□□□□ 0.228e-11■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-12■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.638e-15■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.065e-7■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 NOC4L-203ENST00000538784 862 ntTSL 222.46■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 NOC4L-202ENST00000535343 669 ntTSL 318.07■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 28.4
PCBP1Q15365 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 314.87□□□□□ -0.036e-9■■■■■ 28.3
PCBP1Q15365 ATXN2L-213ENST00000564162 770 ntTSL 519.48■□□□□ 0.713e-16■■■■■ 28.3
PCBP1Q15365 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 28.3
PCBP1Q15365 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.85e-10■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 CLSTN3-204ENST00000535313 787 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-10■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.356e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.136e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.236e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-205ENST00000527322 1000 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.376e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-206ENST00000527820 3211 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.376e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.376e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.446e-19■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 PRRC2A-212ENST00000487089 732 ntTSL 29.5□□□□□ -0.895e-10■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 215.75■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 DLG4-209ENST00000491753 869 ntTSL 216.08■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 28.2
PCBP1Q15365 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.148e-12■■■■■ 28.2
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 172.4 ms