RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340833.4

CDC25B-202, Transcript of cell division cycle 25B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC25B, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25B-202ENST00000340833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.88■■■■■ 4.61
CDC25B-202ENST00000340833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.83■■■■□ 3.81
CDC25B-202ENST00000340833 ABCC9O60706 1549 aa37.71■■■■□ 3.63
CDC25B-202ENST00000340833 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CDC25B-202ENST00000340833 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.51■■■■□ 3.43
CDC25B-202ENST00000340833 NACADO15069 1562 aa36.36■■■■□ 3.41
CDC25B-202ENST00000340833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.33■■■■□ 3.41
CDC25B-202ENST00000340833 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.24■■■■□ 3.39
CDC25B-202ENST00000340833 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.22■■■■□ 3.39
CDC25B-202ENST00000340833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.72■■■■□ 3.31
CDC25B-202ENST00000340833 SCRIBQ14160 1630 aa35.57■■■■□ 3.29
CDC25B-202ENST00000340833 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.34■■■■□ 3.25
CDC25B-202ENST00000340833 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
CDC25B-202ENST00000340833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.01■■■■□ 3.19
CDC25B-202ENST00000340833 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
CDC25B-202ENST00000340833 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.3■■■■□ 3.08
CDC25B-202ENST00000340833 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.22■■■■□ 3.07
CDC25B-202ENST00000340833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.12■■■■□ 3.05
CDC25B-202ENST00000340833 SMARCA4P51532 1647 aa34■■■■□ 3.03
CDC25B-202ENST00000340833 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CDC25B-202ENST00000340833 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.89■■■■□ 3.02
CDC25B-202ENST00000340833 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.68■■■□□ 2.98
CDC25B-202ENST00000340833 SMARCA2P51531 1590 aa33.61■■■□□ 2.97
CDC25B-202ENST00000340833 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.61■■■□□ 2.97
CDC25B-202ENST00000340833 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
CDC25B-202ENST00000340833 WIZO95785 1651 aa33.59■■■□□ 2.97
CDC25B-202ENST00000340833 NCAPD3P42695 1498 aa33.55■■■□□ 2.96
CDC25B-202ENST00000340833 HMGXB3Q12766 1538 aa33.45■■■□□ 2.94
CDC25B-202ENST00000340833 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
CDC25B-202ENST00000340833 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
CDC25B-202ENST00000340833 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
CDC25B-202ENST00000340833 NESP48681 1621 aa32.79■■■□□ 2.84
CDC25B-202ENST00000340833 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.78■■■□□ 2.84
CDC25B-202ENST00000340833 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.63■■■□□ 2.81
CDC25B-202ENST00000340833 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.59■■■□□ 2.81
CDC25B-202ENST00000340833 CFTRP13569 1480 aa32.52■■■□□ 2.8
CDC25B-202ENST00000340833 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.42■■■□□ 2.78
CDC25B-202ENST00000340833 ERCC6Q03468 1493 aa32.39■■■□□ 2.78
CDC25B-202ENST00000340833 PRDM2Q13029 1718 aa32.38■■■□□ 2.77
CDC25B-202ENST00000340833 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.33■■■□□ 2.77
CDC25B-202ENST00000340833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.27■■■□□ 2.76
CDC25B-202ENST00000340833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CDC25B-202ENST00000340833 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.18■■■□□ 2.74
CDC25B-202ENST00000340833 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.05■■■□□ 2.72
CDC25B-202ENST00000340833 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CDC25B-202ENST00000340833 WDR62O43379 1518 aa31.96■■■□□ 2.71
CDC25B-202ENST00000340833 CUX2O14529 1486 aa31.85■■■□□ 2.69
CDC25B-202ENST00000340833 TOPBP1Q92547 1522 aa31.82■■■□□ 2.68
CDC25B-202ENST00000340833 ABCC8Q09428 1581 aa31.8■■■□□ 2.68
CDC25B-202ENST00000340833 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.8■■■□□ 2.68
CDC25B-202ENST00000340833 CUX1P39880 1505 aa31.77■■■□□ 2.68
CDC25B-202ENST00000340833 SYNJ1O43426 1573 aa31.64■■■□□ 2.66
CDC25B-202ENST00000340833 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.63■■■□□ 2.65
CDC25B-202ENST00000340833 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
CDC25B-202ENST00000340833 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.57■■■□□ 2.64
CDC25B-202ENST00000340833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.56■■■□□ 2.64
CDC25B-202ENST00000340833 TOP2BQ02880 1626 aa31.55■■■□□ 2.64
CDC25B-202ENST00000340833 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CDC25B-202ENST00000340833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.48■■■□□ 2.63
CDC25B-202ENST00000340833 IFT140Q96RY7 1462 aa31.45■■■□□ 2.63
CDC25B-202ENST00000340833 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CDC25B-202ENST00000340833 SOGA1O94964 1423 aa31.4■■■□□ 2.62
CDC25B-202ENST00000340833 WDR97A6NE52 1622 aa31.34■■■□□ 2.61
CDC25B-202ENST00000340833 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
CDC25B-202ENST00000340833 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.597e-7■■■■□ 23.7
CDC25B-202ENST00000340833 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CDC25B-202ENST00000340833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.23■■■□□ 2.59
CDC25B-202ENST00000340833 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.14■■■□□ 2.58
CDC25B-202ENST00000340833 TRIM41Q8WV44 630 aa31.1■■■□□ 2.57
CDC25B-202ENST00000340833 PBRM1Q86U86 1689 aa31.07■■■□□ 2.56
CDC25B-202ENST00000340833 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.07■■■□□ 2.56
CDC25B-202ENST00000340833 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.03■■■□□ 2.56
CDC25B-202ENST00000340833 GRIN2BQ13224 1484 aa30.98■■■□□ 2.55
CDC25B-202ENST00000340833 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.96■■■□□ 2.55
CDC25B-202ENST00000340833 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.91■■■□□ 2.54
CDC25B-202ENST00000340833 KIF27Q86VH2 1401 aa30.89■■■□□ 2.54
CDC25B-202ENST00000340833 CHD1O14646 1710 aa30.86■■■□□ 2.53
CDC25B-202ENST00000340833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CDC25B-202ENST00000340833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.85■■■□□ 2.53
CDC25B-202ENST00000340833 ADAMTS12P58397 1594 aa30.81■■■□□ 2.52
CDC25B-202ENST00000340833 IGF1RP08069 1367 aa30.76■■■□□ 2.51
CDC25B-202ENST00000340833 FBLN2P98095 1184 aa30.75■■■□□ 2.51
CDC25B-202ENST00000340833 SYNJ2O15056 1496 aa30.75■■■□□ 2.51
CDC25B-202ENST00000340833 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.68■■■□□ 2.5
CDC25B-202ENST00000340833 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CDC25B-202ENST00000340833 CUL7Q14999 1698 aa30.66■■■□□ 2.5
CDC25B-202ENST00000340833 GRIN2AQ12879 1464 aa30.62■■■□□ 2.49
CDC25B-202ENST00000340833 OSCARQ8IYS5 282 aa30.59■■■□□ 2.49
CDC25B-202ENST00000340833 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CDC25B-202ENST00000340833 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.56■■■□□ 2.48
CDC25B-202ENST00000340833 CEP170Q5SW79 1584 aa30.53■■■□□ 2.48
CDC25B-202ENST00000340833 EEA1Q15075 1411 aa30.49■■■□□ 2.47
CDC25B-202ENST00000340833 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.46■■■□□ 2.47
CDC25B-202ENST00000340833 NUP160Q12769 1436 aa30.46■■■□□ 2.47
CDC25B-202ENST00000340833 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.45■■■□□ 2.47
CDC25B-202ENST00000340833 PRXQ9BXM0 1461 aa30.45■■■□□ 2.46
CDC25B-202ENST00000340833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.45■■■□□ 2.46
CDC25B-202ENST00000340833 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.43■■■□□ 2.46
CDC25B-202ENST00000340833 KIF21BO75037 1637 aa30.27■■■□□ 2.44
CDC25B-202ENST00000340833 SHROOM2Q13796 1616 aa30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms