Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM28Q13263 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM28Q13263 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM28Q13263 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM28Q13263 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM28Q13263 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM28Q13263 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM28Q13263 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM28Q13263 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM28Q13263 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
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