Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF5Q13243 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF5Q13243 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms