Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APBA1Q02410 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APBA1Q02410 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.2 ms