Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCEQ02156 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCEQ02156 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms