Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX1Q01196 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RUNX1Q01196 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms