Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KPNA2P52292 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms