Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP11P51784 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP11P51784 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP11P51784 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP11P51784 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP11P51784 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP11P51784 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP11P51784 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP11P51784 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP11P51784 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP11P51784 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP11P51784 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP11P51784 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP11P51784 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP11P51784 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP11P51784 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP11P51784 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP11P51784 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP11P51784 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP11P51784 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP11P51784 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP11P51784 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms