Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCP4P48539 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCP4P48539 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCP4P48539 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCP4P48539 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCP4P48539 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCP4P48539 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCP4P48539 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms