Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	STV1	YMR054W	2673 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PCL10	YGL134W	1302 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	KIN3	YAR018C	1308 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	YCR050C	YCR050C	309 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PFA5	YDR459C	1125 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	SAE3	YHR079C-A	276 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	PRP19	YLL036C	1512 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	SOF1	YLL011W	1470 nt		3.78	□□□□□ -1.8
ATG12	P38316	ENT1	YDL161W	1365 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	RAD4	YER162C	2265 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	ULS1	YOR191W	4860 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	HOM2	YDR158W	1098 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	RPB7	YDR404C	516 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	MOB2	YFL034C-B	864 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	FOL2	YGR267C	732 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	GVP36	YIL041W	981 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	COQ5	YML110C	924 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	IMP2	YMR035W	534 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.77	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	MDM30	YLR368W	1797 nt		3.76	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	CDC6	YJL194W	1542 nt		3.76	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	SSA2	YLL024C	1920 nt		3.76	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	IRC9	YJL142C	393 nt		3.76	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	BSD2	YBR290W	966 nt		3.76	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	SSB1	YDL229W	1842 nt		3.76	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	BOI2	YER114C	3123 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	GSM1	YJL103C	1857 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	RKM4	YDR257C	1485 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	TIM21	YGR033C	720 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YML119W	YML119W	1074 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	OSW1	YOR255W	837 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	ANT1	YPR128C	987 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	JEN1	YKL217W	1851 nt		3.75	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	SNF2	YOR290C	5112 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	HOM3	YER052C	1584 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	SDS3	YIL084C	984 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YKR047W	YKR047W	306 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	NSE1	YLR007W	1011 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	ELO3	YLR372W	1038 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	RIB4	YOL143C	510 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	OPY1	YBR129C	987 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	ELM1	YKL048C	1923 nt		3.74	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	TCM62	YBR044C	1719 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	JLP1	YLL057C	1239 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	RPS31	YLR167W	459 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	PFA4	YOL003C	1137 nt		3.73	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	PRM2	YIL037C	1971 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	NAM2	YLR382C	2685 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	FAD1	YDL045C	921 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YDR090C	YDR090C	933 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YGR079W	YGR079W	1113 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	SOP4	YJL192C	705 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	YMR085W	YMR085W	1299 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	POF1	YCL047C	777 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	IZH3	YLR023C	1632 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	APE2	YKL157W	2859 nt		3.72	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	CNA1	YLR433C	1662 nt		3.71	□□□□□ -1.81
ATG12	P38316	TAF12	YDR145W	1620 nt		3.71	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	MNN1	YER001W	2289 nt		3.71	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SEC53	YFL045C	765 nt		3.71	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	PIR3	YKL163W	978 nt		3.71	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YLL017W	YLL017W	312 nt		3.71	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	PTR3	YFR029W	2037 nt		3.71	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SAT4	YCR008W	1812 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	AIR1	YIL079C	1083 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	GTT2	YLL060C	702 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	RPS1B	YML063W	768 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YPR015C	YPR015C	744 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	CTR1	YPR124W	1221 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	GCN5	YGR252W	1320 nt		3.7	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	HMG1	YML075C	3165 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	CTF18	YMR078C	2226 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	YGL193C	YGL193C	312 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	GTT1	YIR038C	705 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	ERG20	YJL167W	1059 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	DAN1	YJR150C	897 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	MRT4	YKL009W	711 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	MUP3	YHL036W	1641 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	NGL3	YML118W	1518 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	OPT2	YPR194C	2634 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.69	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	GPB1	YOR371C	2694 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	HFD1	YMR110C	1599 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.68	□□□□□ -1.82
ATG12	P38316	NFI1	YOR156C	2181 nt		3.68	□□□□□ -1.82

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