Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB4P28070 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB4P28070 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms