Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMBSP08397 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMBSP08397 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMBSP08397 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMBSP08397 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMBSP08397 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMBSP08397 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMBSP08397 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMBSP08397 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMBSP08397 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms