Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF1P04155 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF1P04155 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFF1P04155 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFF1P04155 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms