Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBXN7O94888 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
UBXN7O94888 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBXN7O94888 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBXN7O94888 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBXN7O94888 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBXN7O94888 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBXN7O94888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBXN7O94888 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN7O94888 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms