Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD6O43541 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms