Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BHMG1C9JSJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMG1C9JSJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms