Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCCD1A6NED2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCCD1A6NED2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms