Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF12Q9Y4X4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms