Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX4Q9Y2E6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX4Q9Y2E6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms