Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
TNIKQ9UKE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms