Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RABGEF1Q9UJ41 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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RABGEF1Q9UJ41 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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RABGEF1Q9UJ41 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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RABGEF1Q9UJ41 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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