Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23BQ9NYZ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms