Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDAP2Q9NXN4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDAP2Q9NXN4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.6 ms