Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BSDC1Q9NW68 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BSDC1Q9NW68 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BSDC1Q9NW68 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BSDC1Q9NW68 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms