Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR1Q9C0D0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms