Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP85Q9BW27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms