Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms