Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms