Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDNQ99608 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDNQ99608 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDNQ99608 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDNQ99608 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDNQ99608 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDNQ99608 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms