Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS50Q96JG6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms