Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC47Q96A33 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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