Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF12Q8WXF0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms