Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N3U1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N3U1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N3U1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N3U1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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