Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDB3Q6NSJ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms