Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC181Q5TID7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC181Q5TID7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC181Q5TID7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms