Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAP47Q5SQN1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms