Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3KQ59H18 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI3KQ59H18 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3KQ59H18 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms