Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHROOM2Q13796 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
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